因为5天冷冻囊胚比3天胚胎在体外多花两天时间，所以3天冷冻囊胚和5天冷冻囊胚的区别在于，5天冷冻囊胚的植入成功率比3天冷冻囊胚高，因为5天冷冻囊胚比3天胚胎多花两天时间，发育成囊胚的胚胎表现出自身基因和适应外界环境的能力比3天冷冻囊胚好，囊胚移植更像是模仿自然妊娠的规律。
卵子和精子在体外取卵后会在体外培养成受精卵，第二天是4细胞胚胎，第三天是8细胞胚胎，前三天是卵裂胚胎。胚胎体外培养5-7天就会形成囊胚，囊胚培养的过程也是一个优胜劣汰的过程。一般质量好的胚胎都可以培养成囊胚，5-7天的囊胚有这些区别:
通常生殖中心采用第二天或第三天移植胚胎的移植方案，此时胚胎一般发育到2-4细胞(第二天)或6-8细胞(第三天)。如果胚胎继续培养到第5-6天，可以发育成囊胚，然后就可以移植了。这个过程称为囊胚培养和囊胚移植。
胚胎和囊胚区别1.时间的定义:胚胎移植一般选择两种策略，即胚胎体外发育至第3天或第5天。第3天的胚胎称为卵裂期胚胎，第5天的胚胎称为囊胚。
2.时间:取卵当天为D0，卵裂期胚胎为取卵后第2-3天的胚胎，囊胚为取卵后第5-7天的胚胎；
3.空 Between:卵裂期的胚胎位于输卵管，而胚泡位于子宫；
4. 形态学:卵裂期胚胎细胞数量少，第二天胚胎数量一般为4细胞左右，第三天胚胎数量一般为8细胞左右，囊胚内细胞数量多，一般为几十个甚至上百个。细胞群分化为滋养层细胞和内细胞团细胞，胚胎内有一空腔，呈空状。
5. 基因:卵裂期胚胎的发育主要依赖于储存在卵子中的遗传物质，这一阶段主要依靠“母亲”的力量来支持，而胚泡的基因调控经历了从母体调控到合子调控的转变，依赖于双亲的力量来生长发育，所以只有好的卵子加上好的精子才有发育成胚泡的潜力。
但并不是每个家庭都适合囊胚移植，如生殖道急性炎症者、盆腔粘连严重者、心脏病、肺病等腹腔镜手术禁忌症者、严重少精、弱精者等。
囊胚移植优缺点优点5天和6天没有本质区别。在试管婴儿中，很重要的一步是胚胎培养，但有些患者因为个人原因，不适合直接进行胚胎移植。这时候医生会建议保留胶囊，帮助患者提高移植的成功率。
建议选择养囊的情况1.受精第二天可获得4个或4个以上正常受精胚胎；
2.在受精的第2-3天完成胚胎移植后剩余的胚胎；
3.严重卵巢过度刺激综合征、生殖道感染、宫内积水等。需要推迟胚胎移植。因为一般胚胎只需要3天就能发育好，如果患者患有疾病，需要推迟移植，那么子宫环境会比一般患者差。此时非常适合将胚胎培养成囊胚，然后冷冻，等待合适的移植时机；
4.经过多次人工授精或移植失败后，囊胚的适应能力要比胚胎强得多，因此移植囊胚的着床成功率要高于胚胎移植。
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