目前精子分离的成功率不高，影响精子分离成功率的因素很多，如精子分离仪器、医生技术水平、精子分离方法等。精子分离主要用于预防伴性遗传疾病，但随着医学技术的快速发展，第三代试管婴儿可以筛查更广泛的遗传疾病，筛查准确率也更高。
对于育龄女性来说，一般做试管婴儿治疗的大部分都是不孕不育患者，但也有少部分是因为家族遗传病，尤其是性连锁遗传病，比如色盲等遗传病。
精子分离术成功率精子分离主要用于预防伴性遗传疾病。随着医学技术的快速发展，需要对非不育家庭进行基因诊断和遗传病筛查。其实可以选择第三代试管婴儿技术。第三代试管婴儿可以筛查更广泛的遗传病，筛查准确率更高。除了筛查遗传病，第三代试管婴儿还可以提高胚胎质量，提高胚胎移植成功的几率。
理论上，男性的X染色体实际上比Y染色体要大。医生可以使用血细胞计数器来减缓流动速度，并将活的X精子和Y精子细胞逐一分离。如果精子分离能大大提高精液样本中Y精子细胞的含量，孕妇怀上男胎的可能性就会增加。
影响精子分离术成功率的因素影响精子分离成功率的因素很多，主要是精子分离仪器、医生的技术水平和精子分离方法。不同医院的医疗服务水平存在差异。使用不同的精子分离仪器对精子分离的成功率影响很大。影响精子分离成功率的因素有三个。详情如下:
精子分离仪器一般来说，精子分离技术难度较大。理论上，男性X精子和Y精子的染色体不同，Y精子游得比X精子快。根据精子的不同特性，可以使用不同的精子分离仪器进行分离，但每种仪器分离精子成功的概率是不同的。
医生技术水平通常在获得男性精子后，医生需要在实验室开始精子分离，分离的成功与否与医生的技术水平有很大关系。一般用荧光染料染色。因为染剂多的X生精细胞会比染剂少的Y生精细胞发出更亮的光，医生可以人工将X生精和Y生精分开，所以这个过程可能会有误差。
精子分离方法目前精子分离方法很多，如荧光剂法、离心分离法、上游提取法、下游沉淀法等。医生使用的精子分离方法不同，精子分离的成功率也不同。
精子分离术的危害精子分离实际上在临床医学上应用并不广泛，目前的临床应用仅限于性连锁遗传病的预防。精子分离有很多危害。从技术上来说，准确分离精子是不可能的。这项技术只是为了降低有遗传病的孩子的出生率。因为在精子分离中可能会用到荧光剂，所以可能会对受精胚胎产生影响。
精子分离确实存在。最早应用于临床预防伴性遗传疾病儿童的出生率，但由于技术含量低，分离准确率低，不被市场接受。精子分离有三个危害，具体内容如下:
1、无法准确分离精子从技术上来说，精子分离的准确率不高，精子分离的过程可以说是低效的，无法准确分离Y精子。如果将分离出来的Y精子植入女性子宫腔，还是有30%的几率失败。
2、影响胚胎健康发育使用XY精子分离，实验室工作人员会用荧光剂做标记，分离出Y精子，比X精子更轻更快。这种方法分离出来的Y精子质量是不确定的，Y精子受精形成的胚胎也会有不可预知的影响。
3、增加堕胎率在日常生活中，确实有伴性遗传疾病的患者，而且这类人的数量还是比较多的。因为技术不高，精子分离技术会间接增加流产率。如果夫妇患有遗传病，为了避免遗传给后代，有更多的辅助生殖技术可供选择。
精子分离技术成功率并不是百分百，会有三成的失败几率。目前大型医院可以做，不过这种技术很容易造成性别失衡，也主要还是用于预防伴性遗传疾病。真正使用过精子分离技术的比较少。
