子宫内膜厚度是影响胚胎着床的重要因素之一。目前没有所谓的标准。一般来说，当子宫内膜达到0.8 cm-1.0 cm左右时，就符合胚胎移植的要求。其实大部分患者的子宫内膜都能达到要求。在治疗过程中，激素类药物的应用也会帮助子宫内膜生长。对于少数子宫内膜较薄的患者，医生会根据个人情况采用药物治疗和子宫内膜刺激。
自然循环月经周期规律、排卵期、子宫内膜发育良好的患者选择自然周期，符合胚胎着床的生理要求，简单经济。通过测定LH峰值和b超检测排卵及子宫内膜发育来选择胚胎移植的时间。
利弊:避免使用外源性性激素，使子宫内膜的变化符合自然生理状态。不适合排卵障碍、月经不调、卵巢功能低下的女性。在月经周期正常的女性中，有5%的周期因为卵泡未发育而被迫采用FET。为了监测黄体生成素峰值和排卵的自然周期，可能需要重复激素测量和超声波监测。
激素替代周期无排卵或既往人工周期排卵障碍(HRT周期)，使用外源性激素抑制卵泡生长直接影响子宫内膜雌激素和孕激素。需要注意的是，少数排卵患者可能仍然不能抑制卵泡发育，因为他们没有被GnRH-a垂体下调。如有初级卵泡发育，可继续激素替代，b超检查主卵泡生长情况。结合血液激素的测定，使血雌激素和孕酮维持在适当的水平，即不影响后续的FET治疗。当然，这种子宫内膜准备方法并不是单纯的激素替代。
优缺点:激素替代周期可以合理安排FET时间，既降低了FET周期的淘汰率，又解决了FET移植时间有限的问题。
微促排卵周期换句话说，hMG促排卵周期属于人工周期，通过外源性药物调节子宫内膜的增殖和转化，可用于月经不调或卵泡发育不良的女性。内源性激素的分泌主要通过刺激卵泡生长来影响子宫内膜。
优点和缺点:hMG促进了更高的成本，需要频繁的监测，并有OHSS的风险。然而，由于产生大量卵泡，这种方法具有高内源性雌激素浓度，这导致子宫内膜反应差。
下调激素替代周期子宫肌瘤、EM(子宫内膜异位症)、子宫腺肌病等良性雌激素依赖性妇科疾病且反复复发的患者中，激素替代治疗28天后GnRH-a调节失败的患者开始准备子宫内膜。
优点:GnRH-a主要调节免疫活性，抑制腹腔内炎症细胞因子和局部炎症反应，但在AM(子宫肌瘤)、EM(子宫内膜异位症)、子宫肌瘤中，可减轻病变，使子宫恢复正常大小和形态。GnRH-a能改善子宫内膜容受性、临床妊娠率和胚胎种植率。
比较各种计划的优势1)自然周期通常需要持续监测卵泡发育来确定胚胎复苏和移植的时间，更有可能因卵泡发育异常而取消周期；
2)微排卵周期可在人体内产生高激素环境，种植窗口可提前打开；
3)人工周期的激素替代具有管理简单、监测频率低、周期取消率低的优点；
4)对于反复失败和子宫肌瘤，子宫内膜异位症患者激素替代周期降低后，子宫腺肌病可以改善子宫内膜容受性和妊娠率。
