试管婴儿的治疗分为三个阶段:术前检查阶段、体外受精治疗周期阶段和胚胎移植后试验阶段。
第一阶段是试管婴儿的术前检查。
女方检查:月经第2-4天(初诊):空取腹腔血检查6项性激素及卵巢储备功能。为了避免多次抽血，试管婴儿的常规术前检查可以同时完成。
月经第10天:查白带、衣原体、支原体等。月经干净后，完善试管婴儿的术前检查。
男性检查:精液检查、常规体检、传染病检查、免疫学检查、染色体检查等。至少三次。
第二阶段，进入试管婴儿治疗周期(第二个月经周期)。
1.月经第2-10天，使用降调节药物，暂时减少促性腺激素的自然产生。控制刺激周期，防止卵泡过早排出，同步卵泡发育。定期做b超检查和激素测定，检测卵子的成熟度，把握获得成熟卵子的好时机。
2.卵泡足够大后，就要停止FSH和LH的治疗，开始注射HCG(人绒毛膜促性腺激素)。这样做的目的是帮助卵子成熟。
3.大约在月经来潮的第15天(注射HCG后34-36小时):取卵当天，女方取卵，男方取精。
4.黄体期(治疗周期后半段):黄体期(治疗周期后半段):取卵当天，可间断使用黄体酮(阴道凝胶制剂或注射)或HCG。这是为了支撑黄体，维持妊娠。
5.胚胎移植:如果在实验室培养中发育出至少一个胚胎，医生一般会在取卵后的第三天用一根细软管将胚胎移植到子宫内。这一步通常是无痛的。每个周期可以移植2-3个胚胎。但如果此时子宫环境不适合胚胎移植，可以考虑先冷冻胚胎，以后再移植。
第三阶段，胚胎移植试验后。
移植后，每天都要对胎儿进行治疗。为了提高妊娠率，移植后2周内禁止性生活和洗澡。移植后14天，进行血液测试和HCG以确认怀孕。如果没有怀孕，找出原因，讨论病例，调整治疗方案。如果有多余的胚胎，在可选的时间选择冷冻胚胎移植。如果没有剩余胚胎，就需要进入下一个治疗周期。
