独眼畸形产生的原因主要是由于胚胎早期在二眼区间的组织发生不全如前脑板的前缘或神经板前下方的中胚层组织受机械或化学物质的损坏，致使二眼向中线并合为一二眼球是由前脑两侧壁突出而成，二眼球之间的发生不全，非但二眼并合，同时。
包括人类在内的一些动物都会出现独眼畸形在母体外捕获独眼鲨鱼还是第一次杰克逊维尔北佛罗里达州大学研究鲨鱼的生物学家表示，科学家此前就曾多次发现独眼鲨鱼胎儿但他们一直未能在母体外捕获独眼鲨鱼，说明这种鲨鱼无法在野外存活很久。
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