优质胚胎移植失败的原因很多，可分为外部原因和内部因素。其中，重要的原因是胚胎本身存在问题，比如胚胎的染色体异常或者免疫系统的疾病。子宫内膜薄、母体感染也会导致移植失败，具体情况具体分析。
优质胚胎移植失败的原因高质量囊胚移植失败的原因很多，包括胚胎本身、子宫、内分泌失调、女性自身问题等，可以综合为六个因素，如:
胚胎本身因素这是成功的关键。胚胎越好，成功率越高。但即使按照现在的评分标准，胚胎评分很好，是优质胚胎，但目前还无法检查出每一个胚胎遗传变异。遗传学的问题很复杂，目前还没有应用到临床上，所以高质量的胚胎不一定能成功。而且随着年龄的增长，胚胎遗传变异和突变的概率会越来越大。
子宫因素子宫内膜薄:部分女性由于反复刮宫和月经异常，子宫内膜薄，导致体外受精后胚胎难以着床。
输卵管积水回流宫腔:积水是输卵管慢性炎症引起的，慢性子宫内膜炎是积水回流宫腔引起的，影响胚胎着床；
子宫畸形:未成熟子宫、鞍状子宫、双角子宫、单角子宫、子宫纵隔等常见畸形都会在一定程度上影响成功率；
子宫内膜异位症、子宫内膜息肉、子宫肌瘤等。，也不同程度地影响成功率，而疾病的严重程度和复杂程度决定了影响的程度。移植前，负责的医生会建议处理这些问题的方法。
内分泌失调自身卵巢功能障碍导致自身内分泌紊乱等问题，如高尿酸血症、甲状腺功能亢进或减退、肾上腺素分泌异常、性激素六项异常等。
囊胚容易变双胞胎的原因由于辅助生殖技术的发展，胚盘细胞很容易变成双胞胎。具体的可能性与辅助生殖技术的发展和激素的应用有关。随着促排卵药物的应用和辅助生殖技术的发展，多胎妊娠的发生率明显增加，胚泡容易变成双胞胎的原因如下:
1.一般来说，胚盘细胞自然变成双胞胎的概率很低。利用体外受精辅助生殖技术，人工受孕可能会增加双胞胎的妊娠率；
2.一般在体外受精过程中广泛使用排卵激素类药物。相关研究表明，激素类药物可使胚胎发生有丝分裂，然后继续发育成双胞胎，也称同卵双胞胎，但同卵双胞胎一般不受外界条件影响；
3.双胞胎的出生与家族遗传的影响密切相关。如果母亲的上一代生了双胞胎，下一代很可能生双胞胎。家族遗传也是生双胞胎的原因之一。
一般来说，胚盘细胞只生出一个胎儿，但不排除双胞胎的可能。胚泡移植是通过植入和生长来进行的。胚盘细胞在发育过程中受多种因素的影响会分裂成两个胚胎，通常在孕早期需要进行超声检查。孕妇应该更加注意自己的健康。
